Früher wurden die Sporen des Bärlapp als harntreibendes Mittel eingesetzt, was aber eher mit der Menge der getrunkenen Flüssigkeit zu tun haben durfte. Pharmakologisch gesehen sind Bärlappsporen eher wirkungslos, weshalb sie später auch als Füllmaterial beim Pillendrehen verwendet wurden.

Die Sporen gewinnt man durch Sammeln der Ähren, die man anschließend an der Sonne trocknen lässt. Die trockenen Ähren werden ausgeklopft und das so entstehende feine Pulver gesiebt, um es von Verunreinigungen zu befreien.

Dieses feine Pulver entzündet sich leicht, verbrennt explosionsartig und wurde deshalb zur Erzeugung von Blitzeffekten in Theatern und als Vorläufer des Blitzlichts in der Fotografie benutzt. Im Showbereich werden Bärlappsporen als gesundheitlich weniger bedenkliche Alternative zu Petroleum oder anderen brennbaren Flüssigkeiten von Feuerspuckern verwendet.

Unter seinem lateinischen Namen Lycopodium findet der Bärlapp in der Homöopathie Anwendung. 

Als traditionelles Heilmittel bei Naturvölkern kam der Bärlapp bei schlecht heilenden Wunden, Krämpfen aller Art, Gicht und Rheuma zum Einsatz.