Die Flimmerhäärchen in den Atemwegen, die für den Schleimtransport nach außen zuständig sind, werden von Eukalyptusöl in ihrer Arbeit unterstützt. Das Abhusten wird erleichtert und das Öl wirkt entkrampfend auf die Atemmuskulatur. Man kann das Öl inhalieren oder mit entsprechenden Cremes auf die Brust auftragen, die Wirkung erfolgt dann durch Einatmen. Die äußerliche Anwendung kann auch örtliche Schmerzen vermindern, deshalb werden Einreibungen mit Eukalyptusöl bei Rheuma zur symptomatischen Schmerzbehandlung eingesetzt.

Der wirksame Bestandteil des ätherischen Öles ist das antiseptisch wirkende Cineol.

Zur Anwendung kommen in der Regel Fertigpräparate mit genau definiertem Inhalt der Wirkstoffe, weil der Anteil an ätherischem Öl von Baum zu Baum unterschiedlich ist.

Bei Säuglingen und Kleinkindern sollte man Eukalypusöl nicht anwenden, es besteht die Gefahr von Atemstillstand.

Innerlich angewandt kann das Öl Erbrechen und Durchfall auslösen.