Die Wurzel der Hauhechel hat harntreibende und entzündungshemmende Eigenschaften, die den enthaltenen Flavonderivaten, dem Alpha-Onocerin sowie dem Medicarpin zugeschrieben werden. Deshalb wird die Pflanze zur Durchspülungsbehandlung bei Entzündung der ableitenden Harnwege angewandt und auch vorbeugend bei Nierengrieß eingesetzt. Aus der Wurzel werden auch entzündungshemmende Präparate zur Behandlung rheumatischer Beschwerden und Gicht hergestellt.

Zur Zubereitung eines Tees gibt man 3 Gramm der Wurzel in 200 ml kochendes Wasser und lässt 5 Minuten ziehen. Davon trinkt man 4-5 Tassen pro Tag.