Die Hundspetersilie enthält giftige Polyacetylene. Durch Verwechslung mit Petersilie oder Kerbel sind schon tödliche Vergiftungen bekannt geworden.

In der Naturheilkunde wird die Hundspetersilie (Aethusa cynapium) nicht angewandt, sehr wohl jedoch in der Homöopathie. Dort dient sie als Medikament bei Brechdurchfällen und Milchunverträglichkeit bei Säuglingen.

Die Blätter der in ganz Europa wachsenden Pflanzen verbreiten beim Zerreiben einen unangenehmen Geruch.