Im Gegensatz zum Echten Lein (Linum usitatissimum) wird der Purgier- oder Wiesenlein (Linum catharticum) in der Naturheilkunde kaum noch angewendet. Früher wurde das harntreibende und abführend wirkende Kraut als Tee verordnet.

In höheren Dosen wirkt der Purgier-Lein brechreizerregend.

Der Lein enthält den Bitterstoff Linin, ätherisches Öl, Harze, Gerbstoffe und geringe Mengen an Blausäureverbindungen.

In der Homöopathie wird das in ganz Europa vorkommende Kraut bei Durchfallerkrankungen verordnet.