Die Wegrauke enthält Glukosinolate, die die Sekretbildung in den oberen Atemwegen fördern und so hartnäckigen Schleim lösen und das Abhusten erleichtern.

Die Spitzen der Triebe und die Blätter werden im Sommer geerntet und getrocknet. Aus ihnen werden dann Aufgüsse, Tinkturen und Hustensaft zubereitet. Für einen Tee lässt man 5 Gramm der getrockneten Pflanze 10 Minuten in einer Tasse kochendem Wasser ziehen. Davon trinkt man maximal 4 Tassen pro Tag. Man kann den Tee auch zum Gurgeln bei Heiserkeit benützen.

Für Kinder ist die Wegrauke nicht geeignet. Beim Erwachsenen kann eine Überdosierung zu Herzrhythmusstörungen führen.

Wegrauke wird als homöopathisches Heilmittel gegen Heiserkeit nach Erkältungen verordnet.